无土育苗的最重要的材料莫非育苗基质所属，育苗基质可以把农作物的根系固定住，并且能够提供良好的根系营养，最终达到对水分，养分，氧气的协调与发展。育苗基质就是俗称的营养土。种植蔬菜和花卉苗木，育苗基质就是生产高质量产品的关键因素，其根本作用就是取代土壤，但是，其营养物质要比土壤丰富得多，通透性更好，适应幼苗生长发育的生理需求。这样植株幼苗才能更好的适应环境，快速生长。
    在选配育苗基质或自制营养土时，应遵从以下几个标准：
•从生态环境角度考虑。要求育苗基质基本上不含活的病菌、虫卵，不含或尽量少含有害物质，以防其随苗移栽时进入生长田，污染环境与食物链。
•育苗基质应与移栽土壤环境保持最大程度上的相似。在营养之外它仍然需要有土壤的其他功能，如利于根系缠绕和较好的保水性等。
•育苗基质以配制有机、无机复合肥基质为好。在利用发酵剂对原材料进行发酵时，应将有机基质和无机基质按照不同育苗品种的要求，科学组配，调节好育苗基质的通气、水分、温度和营养状况。
•尽量选择使用当地资源丰富、价格低廉的轻基质。在应用穴盘育苗（在选择了合适的育苗穴盘前提下）技术时，如何选择育苗基质或发酵原材料是关系到育苗成本和育苗质量的首要问题。通常情况下应充分挖掘和利用当地便利条件，选择适合穴盘育苗的轻基质资源，降低育苗基质的成本投入，从而降低穴盘苗的销售价格，提高其市场竞争力。根据各地实际情况，一般选用炭化稻壳、棉籽壳、麦壳、锯末、蛭石、珍珠岩等价格低廉基质作穴盘育苗基质。
    对于育苗基质的研究与发展，其中重要基本关键是基质育苗与栽培的基础，然而无土育苗的栽培是否成功是基质选择的关键所在。
    目前从国内外的育苗基质行业来看，对它的研究主要是集中在基质原材料的开拓与发展，对育苗基质的选材方面并不是很详细充分。
    对于最专用的育苗基质的选择，不仅仅是影响农作物的产量，产值，而且还是影响幼苗的生长速度和质量。
    筛选出专用育苗基质是每个育苗基质厂家关键技术之一。
    筛选专用育苗基质的原材料进行试验，应该对其做好充分的计划与记录。